Elle est un membre de l'organisation akatsuki dont elle est la seule représentante féminine. Elle fait équipe avec Pein qui est également le leader de l'organisation , et ils sont les seuls membre de l'organisation a s'être connu avant l'akatsuki. Ils étaient amis d'enfance. Konan est surnommé par les ninja d'Ame " l'Ange de dieux " .
Elle perd ses parents durant son enfance , tués dans une guerre que mène le pays de la Pluie
, et a vécue en companie de deux autres orphelins du nom de Yahiko et Nagato (qui par la suite prendra le nom de Pein) . Tuot les trois ont rencontrer Jiraya (venu se battre contre les ninja d'Ame avec Tsunade et Orochimaru) qui a accepté de vivre un moment avec eux pour leur enseigné des ninjutsu pour qu'ils puissent se débrouller seul. Elle est très douée pour le pliage de papier (origami) et offre un rose en papier a Jiraya en guise de remerciement. Elle a fait de sa " passion " un style de combat.
Des années plus tard , elle le revoit de nouveau , mais cette fois pour l'affronter en tant qu'adversaire....